Появление новых видов коронавируса могут появиться, в следствии заражения животного двумя разными штаммами в одно и то же время, вызывая рекомбинацию вирусного генетического материала в одной клетке. По мнению ученых SARS-CoV-2 –результат гомологичной рекомбинации различных штаммов коронавирусов летучих мышей, через промежуточного хозяина, был перенесен на человека. Таким промежуточным хозяином, вероятно, был один из видов панголинов.
Без появления новой волны заболеваемости среди людей, невозможно выяснить исток зарождения коронавируса и пройденный им путь. Для определения прогноза возможных вариантов возникновения новых патогенов, исследователи из Ливерпульского университета во главе с Майей Варде(Maya Wardeh) из Института инфекций решили выяснить, насколько разные млекопитающие восприимчивы к разным коронавирусам.
Исследования свидетельствует о существования как минимум в 11 раз больше ассоциаций между видами млекопитающих и штаммами коронавируса, чем до сих пор демонстрировали эмпирические наблюдения, и примерно в 40 раз больше видов млекопитающих с четырьмя и более штаммами коронавируса, чем считали ранее.
Ученые смогли выявить виды животных, в которых может происходить рекомбинация SARS-CoV-2 с образованием новых штаммов. Их количество превысило более, чем в 30 раз известных до настоящего времени. Перечень идентифицированных хозяев новых коронавирусов свидетельствует о новых представителях животного мира, среди которых кошки, ежи и кролики.
Несмотря на проведенные исследования с ограниченными данными о геномах коронавируса и ассоциациях вирус — хозяин, масштаб генерации новых коронавирусов у диких и домашних животных был сильно недооценен.